引起肺炎的原因有4个：病毒侵入感染、环境原因、气温变化、异物入侵。

1、病毒侵入感染

禽舍通常的遮挡较好，不通光，潮湿的环境滋养着大量的真菌，还有沙门氏杆菌、大肠杆菌、禽霍乱、家禽鹦鹉病等等都会使家禽肺部感染。真菌性感染主要是曲霉菌病，病原为烟曲霉菌和黄曲霉菌为主，主要侵害肺和气囊，多见于雏禽。大肠杆菌感染易由支原体禽病引发并大多数情况下与沙门氏杆菌交叉混合感染，继而侵入肺部；引发肺炎。沙门氏杆菌病又称白痢，多发于雏鸡，一旦发病，死亡率相当高。

2、环境原因

规模化养殖禽舍一般都是封闭的，特别是鸡舍，从幼鸡到舍到养肥出售，无法进行阶段性的完整清扫鸡舍，大量粪便和残余饲料的长期堆积造成圈舍内充斥着大量有害气体；加上鸡舍环境的污秽潮湿，通风不良，空气的流动性较差，换气不畅，造成空气不洁，大量的家禽拥挤在一起，很容易造成呼吸道疾病，进而引发肺炎。

3、气温变化

有的禽舍遮挡保温条件差，季节交变时刻或是气候温度骤变，家禽容易感冒。特别是羽毛未丰满的时候或是冬秋突然降温的季节，更易出现感冒状况。

4、异物入侵

这主要发生在鸭、鹅习水性家禽。当鸭、鹅群放牧的时候，若是遇到狂风暴雨及台风的袭击，鸭、鹅的鼻孔位于喙的背面，喙扁而平、面积大，很容易把密集雨滴吸入，或雨水随羽毛流入鼻孔而被吸入肺，引发异物性肺炎或坏疽性肺炎。